Szakdolgozat-választás

A hallgató neve: Tüske Milán specializációja: Orvosi fizika MSc
A záróvizsgát szervező tanszék neve: Fizika Tsz.
A témavezető neve: Dr. Gyebnár Gyula
- munkahelye: Semmelweis Egyetem, Neuroradiológia Tanszék
- beosztása: tudományos munkatárs, MR fizikus
- email címe: gyebnar.gyula@semmelweis.hu
A konzulens neve: Dr. Simon Ferenc
- tanszéke: Fizika Tsz.
- beosztása: Egyetemi tanár
- email címe: simon.ferenc@ttk.bme.hu
A kidolgozandó feladat címe: Térinhomogenitás-korrekciók hatása funkcionális MRI felvételekből számolt aktivitástérképeken
A téma rövid leírása, a megoldandó legfontosabb feladatok felsorolása:

A funkcionális MRI (fMRI) felvételeket alap- és klinikai kutatásokban elterjedten alkalmazzák,[1] idegsebészeti beavatkozások tervezése során a védendő, különböző funkciókat egészségesen ellátó agyterületek egyedi aktivitási mintázatának meghatározásában kapnak szerepet. [2] A neuronális aktivitás lokális fokozódására a területre áramló vér oxigenizáltságának megfigyelésén (blood-oxygen level dependent, BOLD) keresztül következtethetünk. Feladatfüggő fMRI vizsgálatokban az aktivációs térképek meghatározásának alapja a BOLD-jel fluktuációinak időbeli korrelációja a feladatot leíró paradigmával. A felvételek értékelésében fontos a megfelelő statisztikai erő, melynek alapját a részletes térbeli és időbeli felbontás, valamint a jó képminőség adja. [3,4]

A Semmelweis Egyetem Orvosi Képalkotó Klinika részeként működő Neuroradiológia Tanszék Philips Ingenia 3T MRI berendezésén rutinszerűen végzünk preoperatív feladatfüggő fMRI vizsgálatokat. A felvételek készítéséhez használt gradiens-echo EPI (GRE-EPI) szekvencia az évek során több változáson esett át a térbeli és időbeli felbontás növelése érdekében (pl. szimultán többszeletes képalkotás alkalmazásával). A tervezett kutatási projektben olyan posztrekonstrukciós korrekciós eljárások alkalmazását vizsgálnánk, melyekkel a mágneses tér lokális inhomogenitásából, valamint egyéb intenzitásingadozásokból eredő képtorzulások mértéke potenciálisan csökkenthető, ezzel a vizsgálatok statisztikai ereje, így diagnosztikai hasznossága is javítható.

A hallgató feladatai:

  • Az fMRI mérés és adatfeldolgozás módszertani alapjainak, a jellemző műtermékeknek, valamint ezek kezelési eljárásainak megismerése, irodalomkutatás.
  • A Tanszéken korábban gyűjtött felvételeknél alkalmazott eljárások és feldolgozó szoftverek megismerése.
  • Részvétel további feladatfüggő fMRI adatok gyűjtésében.
  • A gyűjtött adatok feldolgozása, korrekciós eljárások alkalmazása, a korrekció aktivációs térképekre gyakorolt hatásának értékelése.

Referenciák:

1.            Orringer, D.A., D.R. Vago, and A.J. Golby, Clinical applications and future directions of functional MRI. Semin Neurol, 2012. 32(4): p. 466-75.

2.            Haller, S. and A.J. Bartsch, Pitfalls in FMRI. Eur Radiol, 2009. 19(11): p. 2689-706.

3.            Kozák, L.R., et al., [Functional magnetic resonance imaging for cortical mapping in epilepsy]. Ideggyogy Sz, 2011. 64(9-10): p. 294-9.

4.            Poldrack, Russell A. et al. “Handbook of Functional MRI Data Analysis: Index.” (2011).

A záróvizsga kijelölt tételei:
Dátum:
Hallgató aláírása:
Témavezető aláírása*:
Tanszéki konzulens aláírása:
A témakiírását jóváhagyom
(tanszékvezető aláírása):
*A témavezető jelen feladatkiírás aláírásával tudomásul veszi, hogy a BME TVSZ 145. és 146.§ alapján az egyetem a képzési célok megvalósulása érdekében a szakdolgozatok, illetve diplomamunkák nyilvánosságát tartja elsődlegesnek. A hozzáférés korlátozása csak kivételes esetben, a dékán előzetes hozzájárulásával lehetséges.
Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem
Természettudományi Kar
1111 Budapest, Műegyetem rakpart 3. K épület I. em. 18.
www.ttk.bme.hu